Choc septique causé par le germe Pantoea dispersa: à propos d´un cas

¹Service de Médecine Interne, Centre Hospitalier Universitaire Joseph Raseta Befelatanana, Antananarivo, Madagascar, ²Service de Rhumatologie, Centre Hospitalier Universitaire Joseph Raseta Befelatanana, Antananarivo, Madagascar, ³Service des Maladies Infectieuses et Parasitaires, Centre Hospitalier Universitaire Joseph Raseta Befelatanana, Antananarivo, Madagascar

^&Auteur correspondant
Havantsoa Nomena Fandresena Andrianarisambatra, Service de Médecine Interne, Centre Hospitalier Universitaire Joseph Raseta Befelatanana, Antananarivo, Madagascar

Introduction    

La bactérie du genre Pantoea est une bactérie bacille gram négatif appartenant à la famille des entérobactéries qui se trouve au niveau des plantes [1,2]. Leur approche phylogénétique est encore à ses débuts. Certains membres du genre Pantoea ont été isolés chez des animaux et des plaies humaines et peuvent être des pathogènes opportunistes. L'infection au Pantoea agglomerans reste le plus fréquement décrit dans la littérature de ce genre [1]. La bactériémie à Pantoea dispersa est encore exceptionnelle de nos jours, puisque 10 cas seulement ont été décrits dans le monde [2] (Tableau 1). A notre connaissance, aucun cas n'a encore été rapporté en Afrique. Nous rapportons ainsi la première observation africaine de bactériémie à Pantoea dispersa avec choc septique.

Patient et observation     

Information sur le patient: il s'agissait d'un homme de 68 ans, d'origine chinoise, habitant de Madagascar depuis des années, tabagique actif à 60 paquets années, ayant comme comorbidités un diabète de type 2 connu depuis 1 an et traité par des anti-diabétique oraux, une hypertension artérielle de grade III traitée, et une Bronchopneumopathie Chronique Obstructive (BPCO) négligée.

Il était déjà hospitalisé dans un service de chirurgie thoracique pour un drainage d'une pleurésie gauche de grande abondance, qui est découverte suite à l'exploration d'une toux sèche évoluant depuis un mois, associée à une dyspnée d'installation progressive, une altération de l'état général, évoluant dans un contexte apyrétique. Le liquide pleural était séro-hématique, exsudatif, riche en cellule avec 1800/mm³ de leucocytes à 54% de lymphocytes, la GeneXpert pour Mycobacterium tuberculosis était positive. La pleurésie était alors traitée comme une tuberculose extrapulmonaire type pleurale, et un traitement par quadrithérapie classique a été initié. Le scanner thoracique révélait des nodules d'allure secondaire, un scanner cérébral et abdomino-pelvien est réalisé à la recherche de la tumeur primitive.

Une tumeur corporéale pancréatique a été découverte. Le taux de CA 19-9 était élevé à 12000/ml. Le patient est ensuite transféré au service d'oncologie où il a bénéficié des séances de chimiothérapie associant capecitabine et oxaliplatine. Au bout d'un mois d'hospitalisation et de traitement par antituberculeux, le patient présentait pour la première fois de la fièvre avec 327 mg/L de Protéine C réactive (CRP) et un diabète déséquilibré. Puis, il a été référé au service de médecine interne.

Résultats cliniques: le patient présentait ensuite un tableau de choc septique avec une hypotension artérielle à 60/50 mmHg et une tachycardie à 128/mn. Le patient était polypnéique à 30 cycles par minute et désaturait à 89% sous 12 L d'oxygène. Les autres appareils étaient sans particularités.

Démarche diagnostique: la bandelette urinaire, l'Examen Cytobactériologique des Urines (ECBU), le Test de Diagnostic Rapide (TDR) paludisme et la sérologie VIH étaient négatifs. L'hémogramme montrait une hyperleucocytose à 53790/mm³ à prédominance neutrophile à 47335/mm³, une thrombopénie (contrôlée au tube citraté) à 25000/mm³. Une série d'hémoculture en pic fébrile était demandée.

Intervention thérapeutique et suivi: une tri-antibiothérapie était introduite, associant une imipenem-cilastatine à raison de 1,5 g/j, une ciprofloxacine injectable à raison de 400 mg x 2/j pendant 10 jours et une amikacine 15 mg/kg/j soit 1g/j pendant 3 jours. Un traitement par amine vasopressive était aussi associé. Deux hémocultures sont revenues positives au germe Pantoea dispersa, identifié par la technique MALDI-TOF après une incubation de 5 jours, sensible à l'ampicilline, à l'amoxicilline-acide clavulanique, au C3G, au pipéracilline-tazobactam, à l'imipeneme, au ciprofloxacine, au lévofloxacine, au norfloxacine, au gentamicine, à l'amikacine et résistant aux furanes.

L'examen cytobactériologique et biochimique du liquide pleural montrait un liquide séro-hématique, transsudatif à 14 g/L, pauvre en cellule avec 170 éléments/mm³ à prédominance neutrophile à 78%, il n'y avait pas eu de germes visibles à l'examen direct et la culture était négative. Une part cardiaque du choc a été écartée par une échographie doppler cardiaque et qui est revenue normale, il n'y avait pas des signes en faveur d'une endocardite. Nous n'avons pas fait de désescalade thérapeutique par rapport à l'antibiothérapie. Le choc était levé à 48 heures après l'antibiothérapie, le patient n'était plus dyspnéique, la CRP est descendue à 85 mg/l au 10^e jour du traitement, les leucocytes et les plaquettes étaient revenus normales respectivement à 6960/mm³ et à 169000/mm³. L'antibiothérapie a été maintenue jusqu'à 15 jours.

Événements indésirables: malheureusement, le patient est décédé suite à une décompensation d'une Broncho-pneumopathie Chronique Obstructive (BPCO) avec hypercapnie.

Discussion     

En analysant les 10 cas qui sont déjà décrits dans la litterature, l'infection au Pantoea dispersa touche essentiellement les personnes immunodéprimées, pouvant donner un sepsis sévère. Notre patient était diabétique, porteur d'un cancer pancréatique, sous chimiothérapie, et atteint d'une tuberculose pleurale. Dans notre cas, la présentation clinique était une pleuropneumopathie compliquée d'un choc septique, qui est similaire à celles qui sont décrites. La porte d'entrée pourrait être le drain thoracique, malgré la négativité de l'examen bactériologique du liquide pleural. Tous ceux-ci confortent la littérature que c'est une infection opportuniste et nosocomiale.

La technique d'identification dont nous avons bénéficié était la MALDI-TOF. Selon plusieurs auteurs, cette technique est rapportée comme fiable pour l'identification du genre Pantoea [10]. Similaire à tous les cas rapportés antérieurement, le germe était sensible à la plupart des antibiotiques. Une thrombopénie est fréquemment retrouvée, qui est liée probablement au sepsis sévère et qui est revenue à la normale après une antibiothérapie efficace. Le traitement était celui d'une infection nosocomiale vue l'aggravation de l'état respiratoire au cours de l'hospitalisation. C'est le même traitement adopté au cours des 10 cas décrits.

Conclusion     

L'infection au Pantoea dispersa est une infection nosocomiale et touche surtout les patients immunodéprimés. Le tableau clinique est un choc septique dans la plupart des cas. C'est un germe multisensible, pourtant il peut être mortel si non pris en charge à temps.

Conflits d'intérêts     

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêts.

Contributions des auteurs     

Tous les auteurs ont contribué à ce travail. Ils ont lu et approuvé la version finale du manuscrit.

Tableau     

Tableau 1: principales caractéristiques de neuf cas d'infection à Pantoea dispersa

Références